绿色荧光蛋白是一类存在于腔肠动物体内的生物发光蛋白。GFP具有多种优点：易于检测，灵敏度高;荧光性质稳定，耐受性强;易于表达，无细胞毒性;可用于活细胞检测。
因此，GFP可作为报告基因用于检测基因表达或调控，或作为融合标签来检测蛋白质分子的定位、迁移、构象变化以及分子间的相互作用，或者靶向标记某些细胞器。
GFP吸收的光谱最大峰值为395nm(紫外)，并有一个峰值为470nm的副吸收峰(蓝光);发射光谱最大峰值为509nm(绿光)，并带有峰值为540nm的侧峰(Shouder)。
虽然450～490nm只是GFP的副吸收峰，但由于该激发光对细胞的伤害更小，因此通常多使用该波段光源(多为488nm)。
此外，GFP的光谱特性与荧光素异硫氰酸盐(FITC)很相似，两者通常共有一套滤光片。GFP荧光极其稳定，在激发光照射下，GFP抗光漂白(Photobleaching)能力比荧光素强，特别是在450～490nm蓝光波长下更稳定。
类似的，GFP融合蛋白的荧光灵敏度远比荧光素标记的荧光抗体高，抗光漂白能力强，因此更适用于定量测定与分析。
由于GFP荧光的产生不需要任何外源反应底物，因此GFP作为一种广泛应用的活体报告蛋白，其作用是任何其它酶类报告蛋白无法比的。
但因为GFP不是酶，荧光信号没有酶学放大效果，因此GFP灵敏度可能低于某些酶类报告蛋白，比如萤火虫荧光素酶等。
观察GFP荧光蛋白方法有：
采用荧光蛋白观测灯是便捷、方便的观察方法，因GFP在470nm有一个很高的吸收峰，采用 470nm激发光源能够激发GFP发出明亮的绿色荧光，在观察gfp荧光时，因为激发光为强烈的蓝色光线，必须佩戴专业的观察眼镜才能观察到清晰的荧光信号。
2. 紫外光源：
采用紫外光源(又叫紫外线灯、黑光灯)观察也非常方便，但如果观察植物，植物叶片的叶绿色在紫外线灯下也会发出荧光，对gfp发出的荧光也会产生干扰，另外，标本长时间在紫外光源照射下对GFP标本组织也会造成破坏。
3.荧光显微镜
荧光显微镜(Fluorescence microscope) ： 荧光显微镜是以紫外线为光源， 用以照射被检物体，使之发出荧光，然后在显微镜下观察物体的形状及其所在位置。
荧光显微镜用于研究细胞内物质的吸收、运输、化学物质的分布及定位等。 细胞中有些物质，如叶绿素等，受紫外线照射后可发荧光;
另有一些物质本身虽不能发荧光，但如果用荧光染料或荧光抗体染色后，经紫外线照射亦可发荧光，荧光显微镜就是对这类物质进行定性和定量研究的工具之一。
目前在常用的方法就是采用荧光显微镜观察，荧光显微镜在实验室非常普及，但不足是必须采集叶片或动物切片进行观察，对培养的标本进行破坏，无法进行活体观察。
